RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 BET1O15155 118 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMP1P01033 207 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP21Q8N119 569 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX19Q8NA77 164 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 UPRTQ96BW1 309 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM106AQ96A25 262 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ISL2Q96A47 359 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf198Q9H425 327 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 GDE1Q9NZC3 331 aa22.42■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf72A6NCS6 295 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 AP1G1O43747 822 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MAKP20794 623 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 OMGP23515 440 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 RDH10Q8IZV5 341 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM213BQ8TBF2 198 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 NIPAL2Q9H841 368 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 F3P13726 295 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 BRICD5Q6PL45 260 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 STEAP1Q9UHE8 339 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ETV7Q9Y603 341 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 KITLGP21583 273 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 IL2RGP31785 369 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 SERINC4A6NH21 518 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MTCP1P56278 107 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 OBP2BQ9NPH6 170 aa22.41■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 E9PI62 339 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF141Q8WVD5 230 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 SGPP1Q9BX95 441 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 BOLA1Q9Y3E2 137 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFAND5O76080 213 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFSF4P23510 183 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFA6Q01524 100 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSM1Q08AH1 577 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 HTR5AP47898 357 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 REEP5Q00765 189 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 STEAP1BQ6NZ63 245 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CMIPQ8IY22 773 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF566Q969W8 418 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 NEURL3Q96EH8 262 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 HHIPQ96QV1 700 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PAPLNO95428 1278 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TLE4Q04727 773 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ESCO2Q56NI9 601 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM4DQ6B0I6 523 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K3Q99759 626 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TAPBPO15533 448 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF74Q16587 644 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM122CQ6P4D5 195 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PKMYT1Q99640 499 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 OR14J1Q9UGF5 321 aa22.4■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 FUCA1P04066 466 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF684Q5T5D7 378 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC30A7Q8NEW0 376 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35B4Q969S0 331 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 TCTN2Q96GX1 697 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 FKRPQ9H9S5 495 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.183e-6■■□□□ 13.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.39■■□□□ 1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf99Q6UX52 265 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf112F2Z3M2 114 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A11P31949 105 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 DDOSTP39656 456 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ARG2P78540 354 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 AVPI1Q5T686 147 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD17B8Q92506 261 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP14A8MT82 685 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CRMP1Q14194 572 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NPSR1Q6W5P4 371 aa22.39■■□□□ 1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms