RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RABL2BQ9UNT1 228 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AUP1Q9Y679 476 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0A6YYJ9 748 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YIG0 161 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF793Q6ZN11 406 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 HDDC2Q7Z4H3 204 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LUZP2Q86TE4 346 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2Y1Q8NGV0 311 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX11GQ96HA9 241 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A1Q9H2B4 701 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC14CA4D256 554 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA3P12429 323 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 UCNP55089 124 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PER3P56645 1201 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MADCAM1Q13477 382 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CEBPEQ15744 281 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IDO2Q6ZQW0 420 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX19Q8NA77 164 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2L5Q8NG80 312 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GAL3ST3Q96A11 431 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GHITMQ9H3K2 345 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM7Q9NQW5 492 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LEUTXA8MZ59 168 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP7O15540 132 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OTX2P32243 289 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PITPNAQ00169 270 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RUNX2Q13950 521 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC41A3Q96GZ6 507 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC23A1Q9UHI7 598 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GVI7 797 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CERS1P27544 350 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 GALEQ14376 348 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC48A1Q6P1K1 146 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8H1Q8NGG4 311 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RADILQ96JH8 1075 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MCHR1Q99705 422 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 YIPF4Q9BSR8 244 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG8Q9BVK2 526 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTRT3Q9BYD9 372 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 EMC3Q9P0I2 261 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 B8ZZF3 427 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPP2O43688 288 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CH25HO95992 272 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TPOP07202 933 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 FOLR3P41439 243 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 NTRK2Q16620 822 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM205BPQ63HN1 556 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 FAAH2Q6GMR7 532 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF7Q7Z4P5 450 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 VRK2Q86Y07 508 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CPOQ8IVL8 374 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP43Q8NFH3 380 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 HGDQ93099 445 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF21AQ96BD5 680 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 URADA6NGE7 173 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A5O76082 557 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ND5P03915 603 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 THBS2P35442 1172 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 FCN2Q15485 313 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB109BQ30KR1 87 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 EIPR1Q53HC9 387 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPAL3Q6P499 406 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX261Q6UWH6 196 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 NRMQ8IXM6 262 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT6Q8N6T7 355 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 EXTL1Q92935 676 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR6Q9GZN1 396 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 UBQLN3Q9H347 655 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR54Q9H977 334 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 CES1P1Q9UKY3 287 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-201ENST00000246533 U3KQ87 197 aa24■■□□□ 1.43
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