RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.25■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 MIB2Q96AX9 1013 aa20.25■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.24■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.24■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 OR10G6Q8NH81 332 aa20.24■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.23■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 MCRIP1C9JLW8 97 aa20.23■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 DCTDP32321 178 aa20.23■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 CTNSO60931 367 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSM4P0C7M7 580 aa20.23■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 NFATC4Q14934 902 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF44Q7L0R7 432 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 RASD2Q96D21 266 aa20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 LSSP48449 732 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB38P57729 211 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 Q499Y3 187 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB12Q8WXK4 309 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 SLITRK2Q9H156 845 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB7A8K855 629 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVK-25P63136 954 aa20.22■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 CBFBQ13951 182 aa20.22■□□□□ 0.83
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