RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	EPHA3	P29320	983 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CRAT	P43155	626 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	P2RY4	P51582	365 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	BST1	Q10588	318 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GNA13	Q14344	377 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM160	Q9NX00	188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	FKBP7	Q9Y680	259 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078		A8MVM7	634 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	HAX1	O00165	279 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	RFXANK	O14593	260 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	BIRC5	O15392	142 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SEC14L2	O76054	403 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CRYAA	P02489	173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CECR9	P0C854	216 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	UQCRB	P14927	111 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	IL2RG	P31785	369 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	THBS4	P35443	961 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CLDN17	P56750	224 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	COPZ1	P61923	177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NAAA	Q02083	359 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GSTA3	Q16772	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf159	Q96HA4	380 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	FAAH	O00519	579 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ANP32D	O95626	131 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	HGFAC	Q04756	655 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NPRL3	Q12980	569 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CR1L	Q2VPA4	569 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078		B9A039	149 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	STAMBP	O95630	424 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KRT75	O95678	551 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NUDT7	P0C024	238 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PNMT	P11086	282 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CAPZA2	P47755	286 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MVD	P53602	400 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	DSTN	P60981	165 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFS8	O00217	210 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	TM9SF1	O15321	606 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	AHSA1	O95433	338 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TCF4-262	ENST00000628078	DAO	P14920	347 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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