RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ZIC4Q8N9L1 334 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 OR2T12Q8NG77 320 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 OR6S1Q8NH40 331 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PIK3IP1Q96FE7 263 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CMTM6Q9NX76 183 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 RASD1Q9Y272 281 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ITPR3Q14573 2671 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 IGHV1-2P23083 117 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CASP12Q6UXS9 341 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 GPAT4Q86UL3 456 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 SLC15A3Q8IY34 581 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 HSD17B8Q92506 261 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TAAR8Q969N4 342 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A36Q96CQ1 311 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CMTM5Q96DZ9 223 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 HIVEP1P15822 2718 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 LYZL6O75951 148 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 IFNA14P01570 189 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 IGHV3-9P01782 118 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TESK1Q15569 626 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ENTPD8Q5MY95 495 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 MICU2Q8IYU8 434 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 UBE2J2Q8N2K1 259 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PROX1Q92786 737 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 EPYCQ99645 322 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ASB6Q9NWX5 421 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 BAG5Q9UL15 447 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ARID1AO14497 2285 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ELOVL7A1L3X0 281 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CHP2O43745 196 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PRDX6P30041 224 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 IST1P53990 364 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 MFSD13AQ14CX5 517 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TAB1Q15750 504 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 RNF217Q8TC41 542 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PLCE1Q9P212 2302 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 PDLIM1O00151 329 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 KDELR2P33947 212 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 NR1H2P55055 460 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CREB3L2Q70SY1 520 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 SSX8Q7RTT4 187 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 WFDC8Q8IUA0 241 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 RAF1P04049 648 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 GGT1P19440 569 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 AAED1Q7RTV5 226 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 LURAP1LQ8IV03 231 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 P3H2Q8IVL5 708 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 HS3ST6Q96QI5 342 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 SLC7A10Q9NS82 523 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 M0R082 166 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 NME4O00746 187 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 LYPD3O95274 346 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 DNASE1P24855 282 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 GRPRP30550 384 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 NUDT2P50583 147 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 SLC7A2P52569 658 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 LIPEQ05469 1076 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 FAPQ12884 760 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 CARM1Q86X55 608 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 ZNF417Q8TAU3 575 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 MBD6Q96DN6 1003 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 MPP4Q96JB8 637 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-220ENST00000618056 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa21.94■■□□□ 1.1
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