RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 MAP3K8P41279 467 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 HSD17B7P56937 341 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PITPNAQ00169 270 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GPR18Q14330 331 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GALEQ14376 348 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ELOCQ15369 112 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DEFB134Q4QY38 66 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 C18orf63Q68DL7 685 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NRMQ8IXM6 262 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR8H2Q8N162 312 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR7G2Q8NG99 324 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 RNF217Q8TC41 542 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RNF31Q96EP0 1072 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SLC35A4Q96G79 324 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CTRCQ99895 268 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SRRQ9GZT4 340 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RAB33BQ9H082 229 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 UBQLN3Q9H347 655 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 EQTNQ9NQ60 294 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 EMC3Q9P0I2 261 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF221Q9UK13 617 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 POMT2Q9UKY4 750 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.35□□□□□ -1.23
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GGA3-218ENST00000584243 GLOD5A6NK44 160 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CENPXA8MT69 81 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 B4E171 279 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 H0YIG0 161 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CYR61O00622 381 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 IMPA2O14732 288 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ORC5O43913 435 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CTNSO60931 367 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TMCC2O75069 709 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 STK17BO94768 372 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CDRT1O95170 752 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 EPPINO95925 133 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 LIMS3P0CW19 117 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 LIMS4P0CW20 117 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 IL7P13232 177 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CTSEP14091 401 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NT5EP21589 574 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DDOSTP39656 456 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ADH7P40394 386 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TSPAN7P41732 249 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FASLGP48023 281 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A8P48029 635 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ETV1P50549 477 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 BLVRAP53004 296 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 EPHA4P54764 986 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SCAND1P57086 179 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR2B6P58173 313 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DCAF7P61962 342 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DNASE1L3Q13609 305 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GGTLC2Q14390 218 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 QPRTQ15274 297 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF141Q15928 474 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DUSP5Q16690 384 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
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