RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 CYS1Q717R9 158 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB8BQ92930 207 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ARL8AQ96BM9 186 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 EGLN2Q96KS0 407 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF75AQ96N20 296 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 LAT2Q9GZY6 243 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CRLF2Q9HC73 371 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 FZR1Q9UM11 496 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 NFU1Q9UMS0 254 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF114Q9Y508 228 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 AUP1Q9Y679 476 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A096LPK6 155 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 C5orf63A6NC05 138 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SRRM5B3KS81 715 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 H0YL77 283 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 H3BNH8 94 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PLATP00750 562 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 BCKDHAP12694 445 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF35P13682 527 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF12P17014 697 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 GLRXP35754 106 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 HSD17B3P37058 310 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CRYBB2P43320 205 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SELENOPP49908 381 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CCL8P80075 99 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 COL10A1Q03692 680 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 NPRL3Q12980 569 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 FXNQ16595 210 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 DCST2Q5T1A1 773 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SZRD1Q7Z422 152 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 MDP1Q86V88 176 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF614Q8N883 585 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 LINC01006Q8NI28 216 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PBKQ96KB5 322 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 STACQ99469 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CHIAQ9BZP6 476 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PIGUQ9H490 435 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PDPK1O15530 556 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 FRS3O43559 492 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ULK1O75385 1050 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP7B1O75881 506 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT6AP02538 564 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT6BP04259 564 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SBK3P0C264 359 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CCNA2P20248 432 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP6V1C1P21283 382 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ARR3P36575 388 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 RAD52P43351 418 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 MTNR1AP48039 350 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT6CP48668 564 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 P2RY4P51582 365 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC35A1P78382 337 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 PLAURQ03405 335 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-217ENST00000580654 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.48□□□□□ -1.37
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