RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A1B0GVX0 72 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 A6NN06 94 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 E9PBE3 544 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ATP9AO75110 1047 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ECI2O75521 394 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CRCPO75575 148 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 GNA14O95837 355 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 MT1BP07438 61 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 SFTPBP07988 381 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 OMGP23515 440 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CALCRP30988 508 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 RFC2P35250 354 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 OPRK1P41145 380 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 HERV-K104P63124 156 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CAMK2DQ13557 499 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 TPBGQ13641 420 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 AP1ARQ63HQ0 302 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CTRB2Q6GPI1 263 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM136Q6ZRR5 245 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 NT5DC3Q86UY8 548 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPBP1Q86WP2 473 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 AQP12AQ8IXF9 295 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF679Q8IYX0 411 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 BATF2Q8N1L9 274 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 NEK11Q8NG66 645 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR9G1Q8NH87 305 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD300LFQ8TDQ1 290 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ART4Q93070 314 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST1H2ACQ93077 130 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 DNAJC19Q96DA6 116 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 NTMT1Q9BV86 223 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 NLNQ9BYT8 704 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 DNTTIP1Q9H147 329 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPDPFQ9H3Y8 114 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 SIAEQ9HAT2 523 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 PFDN4Q9NQP4 134 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCL28Q9NRJ3 127 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM161AQ9NX61 479 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.28□□□□□ -2.45
IGKV1-22-201ENST00000524313 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTPRUQ92729 1446 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 ITIH6Q6UXX5 1313 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A0G2JRQ6 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLAC8L1A1L4L8 177 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHEK1O14757 476 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 BUB1O43683 1085 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGHV1-8P0DP01 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 HRES1P13985 223 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNR1P21554 472 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 NMT1P30419 496 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAMPTP43490 491 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 SGSHP51688 502 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 CAPZA1P52907 286 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 FUT5Q11128 374 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDIA5Q14554 519 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPCS2Q15005 226 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 LIPNQ5VXI9 398 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCYL2Q6P3W7 929 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 LYPD2Q6UXB3 125 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 HACD2Q6Y1H2 254 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 STAC2Q6ZMT1 411 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM126BQ8IUX1 230 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMC5Q8IY18 1101 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 C15orf56Q8N910 161 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC191Q8NCU4 936 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR4F15Q8NGB8 312 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR10G4Q8NGN3 311 aa-0.29□□□□□ -2.46
IGKV1-22-201ENST00000524313 BRSK1Q8TDC3 778 aa-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms