RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TEAD1P28347 426 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FRG2Q64ET8 278 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EID2BQ96D98 161 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FRG2BQ96QU4 278 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 STRADBQ9C0K7 418 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NOX3Q9HBY0 568 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP57Q9NU63 452 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LAMA3Q16787 3333 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HMSDA8MTL9 139 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LRRN3E7EW58 273 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RNF13O43567 381 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DUX1O43812 170 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 UBL3O95164 117 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NTN1O95631 604 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 C8GP07360 202 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 F3P13726 295 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 IFNGR1P15260 489 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PPT1P50897 306 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 GPR143P51810 404 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 APOOLQ6UXV4 268 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 THEM6Q8WUY1 208 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 IFT27Q9BW83 186 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 JAM3Q9BX67 310 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MFFQ9GZY8 342 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 KLK11Q9UBX7 282 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2CO00762 179 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 UBXN7O94888 489 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SPI1P17947 270 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CD22P20273 847 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRPH2P23942 346 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 STX4Q12846 297 aa9.29□□□□□ -0.92
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TRPS1-211ENST00000520276 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MOB3CQ70IA8 216 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MOKQ9UQ07 419 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SPTBN2O15020 2390 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PIAS2O75928 621 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF44P15621 663 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PFN3P60673 137 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FZD2Q14332 565 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CSRP2Q16527 193 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HACD4Q5VWC8 232 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR2L2Q8NH16 312 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TBX5Q99593 518 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FN3KQ9H479 309 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PRB8 838 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CLN5O75503 358 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CEACAM5P06731 702 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CPN1P15169 458 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFB7P17568 137 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 BDKRB2P30411 391 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ADH7P40394 386 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 GCGRP47871 477 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RAE1P78406 368 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 BLOC1S1P78537 153 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SORDQ00796 357 aa9.28□□□□□ -0.92
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