RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 A0A0U1RQS6 177 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 A0A1W2PN81 502 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LIPT2A6NK58 231 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 IQCF5A8MTL0 148 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 WASH3PC4AMC7 463 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 E5RI56 91 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 E9PI62 339 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 H3BNH8 94 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 K7ERQ8 282 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 UPK1AO00322 258 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ACOX3O15254 700 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CRCPO75575 148 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 OR6B1O95007 311 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 NXPH2O95156 264 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 PGM3O95394 542 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 IGLV3-19P01714 112 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 GP1BAP07359 652 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CAPN1P07384 714 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 GSTT2P0CG29 244 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 GSTT2BP0CG30 244 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ALPPL2P10696 532 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 UMPSP11172 480 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 UGT1A6P19224 532 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 GGT1P19440 569 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 UGT1A4P22310 534 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 PTPN6P29350 595 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CD70P32970 193 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CHRNA7P36544 502 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 HNF4AP41235 474 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 RGS4P49798 205 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 TPMTP51580 245 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 OR4D2P58180 307 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 RPL38P63173 70 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 EMX2Q04743 252 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LIPEQ05469 1076 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 PRKG2Q13237 762 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SELPLGQ14242 412 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 NADK2Q4G0N4 442 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 MPPE1Q53F39 396 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 TTC23LQ6PF05 361 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LACC1Q8IV20 430 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 APCDD1Q8J025 514 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SLC34A3Q8N130 599 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 EID2Q8N6I1 236 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 OR2AP1Q8NGE2 309 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 FIBINQ8TAL6 211 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 DDI1Q8WTU0 396 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 STARD8Q92502 1023 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ESAMQ96AP7 390 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 VPS33AQ96AX1 596 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CNBD2Q96M20 576 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 DACH2Q96NX9 599 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SLC29A1Q99808 456 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CIB1Q99828 191 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 CTRCQ99895 268 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 NTMT1Q9BV86 223 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LRRC61Q9BV99 259 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 TPK1Q9H3S4 243 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 SGK2Q9HBY8 427 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 IL26Q9NPH9 171 aa3.69□□□□□ -1.82
RUFY3-215ENST00000515479 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms