RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHE	Q5VZ18	495 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDM8	Q8N371	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP22	Q9UPT9	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087WUJ7	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R3H8	397 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	OVOL3	O00110	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLOCK	O15516	846 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	AHSA1	O95433	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD3E	P07766	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCGF2	P35227	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTH2R	P49190	550 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELENOP	P49908	381 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARFIP2	P53365	341 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPOCK1	Q08629	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf82	Q8WW14	230 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PERP	Q96FX8	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	NGB	Q9NPG2	151 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R082	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINB7	O75635	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF432	O94892	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAMP5	O95183	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	HPR	P00739	348 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD8A	P01732	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	BGLAP	P02818	100 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOSL1	P15407	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTN	P21246	168 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPG	P29372	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRPR	P30550	384 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH12	P55289	794 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	COQ5	Q5HYK3	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM225	Q6GV28	225 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMR3A	Q99954	134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRN3	E7EW58	273 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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