RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 BCKDHAP12694 445 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 CCL5P13501 91 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 TNFRSF1BP20333 461 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 C4BPBP20851 252 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 IL12BP29460 328 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NPBWR2P48146 333 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ART1P52961 327 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 RBBP4Q09028 425 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 SNTA1Q13424 505 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ART3Q13508 389 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 RAB35Q15286 201 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 XKR4Q5GH76 650 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 REEP3Q6NUK4 255 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 Q6ZSR3 168 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ANKRD7Q92527 254 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NTNG2Q96CW9 530 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NANSQ9NR45 359 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 LAMA3Q16787 3333 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PLXNB2O15031 1838 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ATAD5Q96QE3 1844 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 TTC28Q96AY4 2481 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 CCDC182A6NF36 153 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 FCN3O75636 299 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 OAZ2O95190 189 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 JCHAINP01591 159 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PRKCGP05129 697 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 MAKP20794 623 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 CERS1P27544 350 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 SAA4P35542 130 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 RPL4P36578 427 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 RGRP47804 291 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ARHGDIBP52566 201 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 TMEM50BP56557 158 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PROK1P58294 105 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ERVK-25P63136 954 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 Q0VFX4 171 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 STX3Q13277 289 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 GPR17Q13304 367 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 CYTH1Q15438 398 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PIGZQ86VD9 579 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ERICH1Q86X53 443 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 KRT222Q8N1A0 295 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 C2orf48Q96LS8 159 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 OPALINQ96PE5 141 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 CLCC1Q96S66 551 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 Q9HAA7 133 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 GALPQ9UBC7 116 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 OARD1Q9Y530 152 aa4.55□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NCOR1O75376 2440 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 MAST2Q6P0Q8 1798 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 K7ERI5 159 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 M0R3G1 203 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 RAB29O14966 203 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 IGHG4P01861 327 aa4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
VNN3-211ENST00000509351 PTH2RP49190 550 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms