RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 C1DQ13901 141 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC17A1Q14916 467 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RY6Q15077 328 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKDD1AQ495B1 522 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 LCN8Q6JVE9 175 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 VWA1Q6PCB0 445 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 VTCN1Q7Z7D3 282 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 LUZP2Q86TE4 346 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM156AQ8NDB6 213 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PIK3C3Q8NEB9 887 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM45BQ96B21 275 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 APH1AQ96BI3 265 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 OXGR1Q96P68 337 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF426Q9BUY5 554 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR14Q9BWN1 585 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNN3Q9UGI6 736 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF229Q9UJW7 825 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR52Q9Y2T5 361 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 NOX1Q9Y5S8 564 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FTCDNL1E5RQL4 147 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf97H3BN30 126 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 AKR7A3O95154 331 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FABP3P05413 133 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 UMPSP11172 480 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF1BP20333 461 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNGR2P38484 337 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 OR3A2P47893 321 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 IL1RL1Q01638 556 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PMS2P3Q13401 168 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 HDDC2Q7Z4H3 204 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 GPAT4Q86UL3 456 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM99Q8N816 258 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 POMGNT2Q8NAT1 580 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 OR9K2Q8NGE7 335 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5J2Q8NH18 312 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM222BQ8WU58 562 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TAAR8Q969N4 342 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 WFDC6Q9BQY6 131 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PTDSS2Q9BVG9 487 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 YY1AP1Q9H869 796 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 IL1RAPQ9NPH3 570 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC4AQ9UMR7 237 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 A4GNTQ9UNA3 340 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM5Q9Y2B1 443 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PRQ8 180 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBAL3A6NHL2 446 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP12BA6NM10 295 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF716A6NP11 495 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CASKO14936 926 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT36O76013 467 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 H1F0P07305 194 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PAX7P23759 505 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DL3P43628 341 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 TGFBR3Q03167 851 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRNB3Q05901 458 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 DGCR6Q14129 220 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 GK3PQ14409 553 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF74Q16587 644 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PLXDC2Q6UX71 529 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZT83 130 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC103Q8IW40 242 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP12AQ8IXF9 295 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00471Q8N535 108 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF610Q8N9Z0 462 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 STEAP2Q8NFT2 490 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 LIPHQ8WWY8 451 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 SGTBQ96EQ0 304 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 DOCK7Q96N67 2140 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 DACH2Q96NX9 599 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PIP5K1AQ99755 562 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT8Q9NY28 637 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF226Q9NYT6 803 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 UPB1Q9UBR1 384 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 RCE1Q9Y256 329 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 M0R082 166 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 BGLAPP02818 100 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 IGFBP2P18065 325 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 GRPRP30550 384 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 PUDPQ08623 228 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZP4Q12836 540 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXW9Q5XUX1 488 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CASP12Q6UXS9 341 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms