RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED17Q9NVC6 651 aa15.34■□□□□ 0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUSD5O60279 629 aa15.33■□□□□ 0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHRNB1P11230 501 aa15.33■□□□□ 0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PBX4Q9BYU1 374 aa15.33■□□□□ 0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNAPC5O75971 98 aa15.33■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC2A10O95528 541 aa15.33■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDNFP39905 211 aa15.33■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC14A1Q13336 389 aa15.33■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR157Q5UAW9 335 aa15.33■□□□□ 0.04
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