RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 PDLIM1O00151 329 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 NUDT2P50583 147 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SLC7A2P52569 658 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 PSME3P61289 254 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 PROX1Q92786 737 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 APH1AQ96BI3 265 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 S100PBPQ96BU1 408 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 MPP4Q96JB8 637 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 EPYCQ99645 322 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 ALG2Q9H553 416 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1W2PPR1 153 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 DCTN3O75935 186 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 FAM107AO95990 144 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 BGLAPP02818 100 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 IGHV1-2P23083 117 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 GSK3BP49841 420 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 CARM1Q86X55 608 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 HSD17B8Q92506 261 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 BOD1Q96IK1 185 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 MUS81Q96NY9 551 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 OXGR1Q96P68 337 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 MS4A18H0YCH9 400 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 CXCR6O00574 342 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 GRPRP30550 384 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 TSC22D1Q15714 1073 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SSX8Q7RTT4 187 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 P3H2Q8IVL5 708 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SCAIQ8N9R8 606 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 NINJ1Q92982 152 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 LIME1Q9H400 295 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 ASB6Q9NWX5 421 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 AKAP6Q13023 2319 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-216ENST00000475195 M0R082 166 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF432O94892 652 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 MT-ATP6P00846 226 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 IGF2P01344 180 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 THRBP10828 461 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 KRT72Q14CN4 511 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 TAB1Q15750 504 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 FXNQ16595 210 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 CBLL1Q75N03 491 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 AAED1Q7RTV5 226 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 GPAT4Q86UL3 456 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 CDH24Q86UP0 819 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 KDM8Q8N371 416 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 FITM2Q8N6M3 262 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 RNF217Q8TC41 542 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 LYZL6O75951 148 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 OR5F1O95221 314 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 IGHV3-9P01782 118 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 TNFRSF1BP20333 461 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 IL32P24001 234 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-216ENST00000475195 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms