RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469793.1

RAD18-208, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RAD18, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD18-208	ENST00000469793	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	FLNC	Q14315	2725 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793		A0A1W2PNV4	684 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	LRRN3	E7EW58	273 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793		M0R082	166 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	CLOCK	O15516	846 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	TIPRL	O75663	272 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	OR7A10	O76100	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	TOX	O94900	526 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	AKR7A3	O95154	331 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	VAMP5	O95183	116 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	CH25H	O95992	272 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	IL2RA	P01589	272 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	IFI30	P13284	250 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	KLK2	P20151	261 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	FAS	P25445	335 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	OMP	P47874	163 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	SLC16A1	P53985	500 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	PER3	P56645	1201 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	PMPCA	Q10713	525 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	POU4F3	Q15319	338 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	ATP6AP1	Q15904	470 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	ABHD3	Q8WU67	409 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	RND1	Q92730	232 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	CCDC120	Q96HB5	630 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	BCO1	Q9HAY6	547 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	FANCF	Q9NPI8	374 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	NANS	Q9NR45	359 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RAD18-208	ENST00000469793	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF716	A6NP11	495 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	HSPB2	A8KAH6	182 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793		H3BNX3	289 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ENTPD5	O75356	428 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	IL18BP	O95998	194 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	LDLR	P01130	860 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	TSPAN19	P0C672	248 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	IFNGR2	P38484	337 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	SLC9A3	P48764	834 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	HSPB2	Q16082	182 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	CDK20	Q8IZL9	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	NAXE	Q8NCW5	288 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	PSD2	Q9BQI7	771 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF724	A8MTY0	619 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	GNGT2	O14610	69 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	KLF4	O43474	513 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	OR10H3	O60404	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	RAMP1	O60894	148 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	CCNB2	O95067	398 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	FUT1	P19526	365 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	MAK	P20794	623 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	CBL	P22681	906 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	CTSS	P25774	331 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	AGTR1	P30556	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	GPR4	P46093	362 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RAD18-208	ENST00000469793	PUDP	Q08623	228 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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