RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 AICDAQ9GZX7 198 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 KLHL31Q9H511 634 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GABARAPH6UMI1 98 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MAN2B1O00754 1011 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 BHLHE40O14503 412 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PPP1R3DO95685 299 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ACTL6AO96019 429 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ASGR2P07307 311 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GALP22466 123 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 IFNGR2P38484 337 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SOX2P48431 317 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SEC13P55735 322 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 BDH1Q02338 343 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MAPK14Q16539 360 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ODF4Q2M2E3 257 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GXYLT1Q4G148 440 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 LIN54Q6MZP7 749 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TSSK4Q6SA08 328 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RTL10Q7L3V2 364 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 KCT2Q8NC54 265 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C3orf49Q96BT1 292 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 BBS4Q96RK4 519 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RASL12Q9NYN1 266 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GNG8Q9UK08 70 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 A0A1B0GTH9 108 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CARNS1A5YM72 827 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 LRIT2A6NDA9 550 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CNR1P21554 472 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ITGB8P26012 769 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 DPP4P27487 766 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PTGFRP43088 359 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PPP2CBP62714 309 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PPP2CAP67775 309 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FOXK2Q01167 660 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HTR3DQ70Z44 454 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF546Q86UE3 836 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FAM129CQ86XR2 697 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR7D2Q96RA2 312 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MS4A8Q9BY19 250 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NIT2Q9NQR4 276 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ASF1AQ9Y294 204 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 A0A0G2JPF8 293 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C4orf47A7E2U8 309 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HMSDA8MTL9 139 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GNB5O14775 395 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ICOSLGO75144 302 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GP1BAP07359 652 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 EPCAMP16422 314 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 STAT5AP42229 794 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NRG3P56975 720 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SHHQ15465 462 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR7A5Q15622 319 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OTPQ5XKR4 325 aa7.3□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms