RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 SLC38A4Q969I6 547 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TAAR8Q969N4 342 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SLC47A1Q96FL8 570 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NANOGQ9H9S0 305 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 C12orf10Q9HB07 376 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MRGBPQ9NV56 204 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NPAP1Q9NZP6 1156 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 RASD1Q9Y272 281 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 VPS13CQ709C8 3753 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ROS1P08922 2347 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 VAMP5O95183 116 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PCGF2P35227 344 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF83P51522 516 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MAPRE2Q15555 327 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 DUSP7Q16829 419 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 Q5PR19 223 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 CREB3L2Q70SY1 520 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC58Q96CX6 371 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MCHR1Q99705 422 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 LAMP3Q9UQV4 416 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 FTCDNL1E5RQL4 147 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SELENOPP49908 381 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 GABRA6Q16445 453 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 FAM91A1Q658Y4 838 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 OR7E24Q6IFN5 339 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 NIPAL3Q6P499 406 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SLC30A8Q8IWU4 369 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF611Q8N823 705 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 FBXW5Q969U6 566 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ECSITQ9BQ95 431 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 M0R082 166 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 OR2T1O43869 369 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 TPST2O60704 377 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 TGFBR3Q03167 851 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 LGALS3BPQ08380 585 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 VMACQ2NL98 169 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 FAM69AQ5T7M9 428 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SHEQ5VZ18 495 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 C10orf53Q8N6V4 93 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF417Q8TAU3 575 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGDIGQ99819 225 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SH3GL1Q99961 368 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC134Q9H6E4 229 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ARMCX1Q9P291 453 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 A0A0B4J2E0 115 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1B0GX12 115 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 BBIP1A8MTZ0 92 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 M0R1B8 84 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ABCD4O14678 606 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 AIM2O14862 343 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 LGI1O95970 557 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF43P17038 809 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 MPGP29372 298 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 GRPRP30550 384 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CDH12P55289 794 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CLDN17P56750 224 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 C1DQ13901 141 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 C5orf46Q6UWT4 87 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SSX8Q7RTT4 187 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 POMGNT2Q8NAT1 580 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 TAMM41Q96BW9 452 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CXorf56Q9H5V9 222 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SLC25A15Q9Y619 301 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 A0A087WUJ7 227 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 PDLIM1O00151 329 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 NQO1P15559 274 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 NRF1Q16656 503 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 KLHL17Q6TDP4 642 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 MUS81Q96NY9 551 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 EPYCQ99645 322 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 EVA1AQ9H8M9 152 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF587BE7ETH6 402 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 FXYD1O00168 92 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 PTH2RP49190 550 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 GZMMP51124 257 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms