RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438005.1

MTND5P28-201, Transcript of MT-ND5 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene MTND5P28, Length 1,594 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTND5P28-201ENST00000438005 REEP3Q6NUK4 255 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PGAP1Q75T13 922 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 C8orf44Q96CB5 159 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ASB9Q96DX5 294 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 LYZL4Q96KX0 146 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SLC29A1Q99808 456 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 GAL3ST1Q99999 423 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 RBKSQ9H477 322 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 NUDT15Q9NV35 164 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 NDE1Q9NXR1 346 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PRODH2Q9UF12 536 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CLSPNQ9HAW4 1339 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 USP47Q96K76 1375 aa3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 A0A0J9YYE9 177 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SERPINE3A8MV23 424 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ERVV-2B6SEH9 535 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 E7ESA3 106 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PSMD11O00231 422 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SIVA1O15304 175 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 AIREO43918 545 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZFAND5O76080 213 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 OR7A10O76100 309 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SCELO95171 688 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TRBC1P01850 177 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SERPINB2P05120 415 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CD55P08174 381 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 BCKDHBP21953 392 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PRKACBP22694 351 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 HMOX2P30519 316 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 HMGCLP35914 325 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 RFX3P48380 749 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ATP4BP51164 291 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 HMGCS2P54868 508 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 RAB10P61026 200 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SLAQ13239 276 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 KRT71Q3SY84 523 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 VWA2Q5GFL6 755 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 C22orf42Q6IC83 251 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF596Q8TC21 504 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 GPR151Q8TDV0 419 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 LGMNQ99538 433 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SYT15Q9BQS2 421 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 WACQ9BTA9 647 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 KDM5CP41229 1560 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 VWDEQ8N2E2 1590 aa3.35□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 GOLGA3Q08378 1498 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 SCN5AQ14524 2016 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 OR5B21A6NL26 309 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.34□□□□□ -1.87
MTND5P28-201ENST00000438005 E9PLD3 99 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms