RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CCL7P80098 99 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 FHL1Q13642 323 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 IL11RAQ14626 422 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NNATQ16517 81 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 EMC4Q5J8M3 183 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf189Q5VU69 101 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 COX15Q7KZN9 410 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR8K3Q8NH51 312 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NUBPLQ8TB37 319 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 AP3S1Q92572 193 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ADOQ96SZ5 270 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF649Q9BS31 505 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MROQ9BYG7 248 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 POLHQ9Y253 713 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CARD8Q9Y2G2 431 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CREBBPQ92793 2442 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PQM1 296 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35F4A4IF30 521 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC182A6NF36 153 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SOCS6O14544 535 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFB5O43674 189 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SCRG1O75711 98 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R3DO95685 299 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MT-ND5P03915 603 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HEXBP07686 556 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SBK2P0C263 348 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TGFBR1P36897 503 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CASRP41180 1078 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HTR3AP46098 478 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 FOXK1P85037 733 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HSF2Q03933 536 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GGTLC2Q14390 218 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PON3Q15166 354 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CD226Q15762 336 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 IGFBP7Q16270 282 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KLHL12Q53G59 568 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR5W2Q8NH69 310 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF563Q8TA94 476 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TM9SF4Q92544 642 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NACC2Q96BF6 587 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OMA1Q96E52 524 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 WDFY2Q96P53 400 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR6C1Q96RD1 312 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms