RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 POT1Q9NUX5 634 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NCDNQ9UBB6 729 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RCE1Q9Y256 329 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GMDSO60547 372 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RDH16O75452 317 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT1A3P0DMM9 295 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT1A4P0DMN0 295 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM34P42696 430 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1024LP59773 190 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2NLQ5JXB2 153 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OVCH1Q7RTY7 1134 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 POMGNT2Q8NAT1 580 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR56B4Q8NH76 319 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA12BQ96MM6 686 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DLL4Q9NR61 685 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIKINA0A087WXM9 373 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM171A2A8MVW0 826 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GATBO75879 557 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SRMP19623 302 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN12P56749 244 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NNATQ16517 81 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TOR2AQ5JU69 321 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF527Q8NB42 609 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GVT2 93 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NCN8 305 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HCRTR1O43613 425 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 POU4F3Q15319 338 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM255AQ5JRV8 349 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SLITRK4Q8IW52 837 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK1A1LQ8N752 337 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP6Q96JE9 813 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HRKO00198 91 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PIN1P1O15428 100 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZP1P60852 638 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1CAP62136 330 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DYRK1AQ13627 763 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ULK3Q6PHR2 472 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR14A16Q8NHC5 309 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RASD2Q96D21 266 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SGTBQ96EQ0 304 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GFI1Q99684 422 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 POLE3Q9NRF9 147 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF879B4DU55 563 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSBP07858 339 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SELENOPP49908 381 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB110Q30KQ9 67 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LSMEM1Q8N8F7 131 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PMM1Q92871 262 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HGDQ93099 445 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WV48 116 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GVI7 797 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6C68A6NDL8 312 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DIO1P49895 249 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS3BPQ08380 585 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TDGQ13569 410 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GGTLC2Q14390 218 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 COL28A1Q2UY09 1125 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FCRLAQ7L513 359 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR9A4Q8NGU2 314 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2T35Q8NGX2 323 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52I2Q8NH67 350 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SORCS2Q96PQ0 1159 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10A4Q9H209 315 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HRASLS2Q9NWW9 162 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PTTG3PQ9NZH4 202 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX14O75381 377 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SPI1P17947 270 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ENPP1P22413 925 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RAG2P55895 527 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-25P63136 954 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HSF2Q03933 536 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00114Q6XXX2 140 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CMIPQ8IY22 773 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NPEPL1Q8NDH3 523 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR11G2Q8NGC1 345 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC3Q9BQI4 270 aa17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms