RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CLCF1Q9UBD9 225 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 PROCRQ9UNN8 238 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 PDE10AQ9Y233 779 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 PAM16Q9Y3D7 125 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 RNF115Q9Y4L5 304 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 BCL10O95999 233 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TGFAP01135 160 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 GYPCP04921 128 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 SERPINA6P08185 405 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 VIMP08670 466 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SOAT1P35610 550 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 FDFT1P37268 417 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CASP3P42574 277 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 RGS4P49798 205 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 LIM2P55344 173 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 UBASH3AP57075 661 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 HERVK_113P63132 956 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK-8P63133 956 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 REEP5Q00765 189 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 DOC2AQ14183 400 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 GGTLC2Q14390 218 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 RAB35Q15286 201 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CARTPTQ16568 116 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 NRF1Q16656 503 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TIGD3Q6B0B8 471 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CASC4Q6P4E1 433 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA21Q7Z572 469 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CTAGE6Q86UF2 777 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC190Q86UF4 302 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 GPSM1Q86YR5 675 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 DPF1Q92782 380 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 PEX13Q92968 403 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TAAR8Q969N4 342 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 NEIL2Q969S2 332 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SLAMF9Q96A28 289 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SMIM10Q96HG1 83 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 SFXN2Q96NB2 322 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 INPP5KQ9BT40 448 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ABHD6Q9BV23 337 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-210ENST00000415055 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 FANCFQ9NPI8 374 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 EQTNQ9NQ60 294 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 HEY2Q9UBP5 337 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 DKKL1Q9UK85 242 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SPACA6W5XKT8 324 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 WDR91A4D1P6 747 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 SERINC4A6NH21 518 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRK-210ENST00000415055 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.98□□□□□ -1.77
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