RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409403.6

CLK1-202, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CLK1, Length 1,664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-202ENST00000409403 MCRIP1C9JLW8 97 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 M0QYT0 321 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TLR4O00206 839 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 MATN3O15232 486 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NKX2-8O15522 239 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ECI2O75521 394 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 IFNGP01579 166 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ADH4P08319 380 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SPP1P10451 314 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CXCL3P19876 107 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 AGTR1P30556 359 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 PCGF2P35227 344 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ASMTP46597 345 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 PGGT1BP53609 377 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CRISP1P54107 249 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CDH4P55283 916 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CLDN8P56748 225 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 STARD6P59095 220 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 KIAA1024LP59773 190 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 PSG6Q00889 435 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ERV3-1Q14264 604 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TMEM132DQ14C87 1099 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 P2RY14Q15391 338 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SYTL3Q4VX76 610 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 IFI44LQ53G44 452 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ELFN2Q5R3F8 820 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SYPL2Q5VXT5 272 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ACSM6Q6P461 480 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NCEH1Q6PIU2 408 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ATRAIDQ6UW56 229 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ALKAL2Q6UX46 152 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 LRRN1Q6UXK5 716 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TMUB2Q71RG4 321 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 GPSM1Q86YR5 675 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 DEFB106AQ8N104 65 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SLC43A2Q8N370 569 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 EID2Q8N6I1 236 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 C15orf54Q8N8G6 183 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 OR4C15Q8NGM1 316 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 OR6K3Q8NGY3 331 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 THAP6Q8TBB0 222 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NR4A3Q92570 626 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NT5C3BQ969T7 300 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 C7orf34Q96L11 122 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 LURAP1Q96LR2 239 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NPY6RQ99463 290 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 DDOQ99489 341 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 DOHHQ9BU89 302 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TRIM62Q9BVG3 475 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ARL6Q9H0F7 186 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 IKZF5Q9H5V7 419 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 LRTM1Q9HBL6 345 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ZNF302Q9NR11 478 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 PXMP2Q9NR77 195 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ASB6Q9NWX5 421 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 DOCK8Q8NF50 2099 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 LAMA1P25391 3075 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ANKRD36A6QL64 1941 aa5□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SPAG17Q6Q759 2223 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 A0A0D9SG52 128 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 TMEM218A2RU14 115 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 MTMR11A4FU01 709 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 C5orf52A6NGY3 159 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 OR6C75A6NL08 312 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 LRRN3E7EW58 273 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CTDSPLO15194 276 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 OR2A4O95047 310 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NFATC1O95644 943 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SOD1P00441 154 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 HIST1H2ABP04908 130 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 IL5P05113 134 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CD63P08962 238 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 RPA2P15927 270 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 MGMTP16455 207 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 GPX2P18283 190 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 CXCL2P19875 107 aa4.99□□□□□ -1.61
CLK1-202ENST00000409403 NPR2P20594 1047 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms