RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MZB1Q8WU39 189 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 FMO2Q99518 471 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A5Q9H3V2 200 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PIF1Q9H611 641 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 CRLF2Q9HC73 371 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 EXD2Q9NVH0 621 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPM1 405 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 M0R233 179 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PEX11AO75192 247 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 GPIP06744 558 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ECHS1P30084 290 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH3B1P43353 468 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM33P57088 247 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 FUT5Q11128 374 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 DDIASQ8IXT1 998 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 CLECL1Q8IZS7 167 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 RNF217Q8TC41 542 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 IFT81Q8WYA0 676 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 RAB8BQ92930 207 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00470Q9BZP3 86 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 OXSMQ9NWU1 459 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 VWFP04275 2813 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM233B4DJY2 109 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PIP5K1BO14986 540 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PLPP2O43688 288 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 SCN2BO60939 215 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 GLRA3O75311 464 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MPZL1O95297 269 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 NR4A1P22736 598 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ARR3P36575 388 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 EVX1P49640 407 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MDP1Q86V88 176 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 LRP11Q86VZ4 500 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ROPN1LQ96C74 230 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 SYT3Q9BQG1 590 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf50Q9BV19 199 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP26Q9BV47 211 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PLIN3O60664 434 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 RP2O75695 350 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 NCR1O76036 304 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 CHEK2O96017 543 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 GUSBP08236 651 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ANPEPP15144 967 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK1P28482 360 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 CASQ1P31415 396 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 NANPQ8TBE9 248 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 POLE3Q9NRF9 147 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 TBK1Q9UHD2 729 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 GSNP06396 782 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 CPA3P15088 417 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MAP2K6P52564 334 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 IL23RQ5VWK5 629 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 DUX5Q96PT3 197 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 CORINQ9Y5Q5 1042 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JMP0 313 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0X1KG70 313 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS23O95084 383 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 MVKQ03426 396 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 BNIP2Q12982 314 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 PGS1Q32NB8 556 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC153Q494R4 210 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms