RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHADO15335 359 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1F1O43749 312 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 LANCL1O43813 399 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC22BO75396 215 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV2-23P01705 113 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPN1MWP04001 364 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV4-1P06312 121 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCNP07585 359 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPN1MW2P0DN77 364 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPN1MW3P0DN78 364 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 STMN1P16949 149 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 COX5AP20674 150 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNR1P21554 472 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCND2P30279 289 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 TDO2P48775 406 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS14P62263 151 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 HMGCS1Q01581 520 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLA2R1Q13018 1463 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 STK11Q15831 433 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 MICBQ29980 383 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 TPGS2Q68CL5 300 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM71F2Q6NXP2 309 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSDL2Q6YN16 418 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC65Q8IXS2 484 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLDN19Q8N6F1 224 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMARCD2Q92925 531 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNK16Q96T55 309 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM117Q9H0C3 514 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRMSQ9H3Y6 488 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 POPDC2Q9HBU9 364 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL26Q9NPH9 171 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC17A5Q9NRA2 495 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIRT7Q9NRC8 400 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLRX2Q9NS18 164 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXC10Q9NYD6 342 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNIP1Q9NZI2 227 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC14L3Q9UDX4 400 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 KDRP35968 1356 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CARMIL3Q8ND23 1372 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PP18 115 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 C7orf66A4D0T2 115 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS37A4D1T9 235 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT87PA6NCN2 255 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 C12orf71A8MTZ7 269 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX7O00628 323 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC31A2O15432 143 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPR2P20594 1047 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMA1P23946 247 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHL30Q0D2K2 578 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PJVKQ0ZLH3 352 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDZK1IP1Q13113 114 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYTH1Q15438 398 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 GUCA2BQ16661 112 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A52Q3SY17 297 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 GGTA1PQ4G0N0 100 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCN12Q6JVE5 192 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLBD1Q6P4A8 553 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEGR1Q7Z3B1 354 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MOB3BQ86TA1 216 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC4FQ8N1N0 589 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CATSPER1Q8NEC5 780 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1N2Q8NGR9 330 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJC19Q96DA6 116 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITCHQ96J02 903 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIT2Q99578 217 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ECSITQ9BQ95 431 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDEM2Q9BV94 578 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB127Q9H1M4 99 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSD3B7Q9H2F3 369 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPH5Q9H2P9 285 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM9SF3Q9HD45 589 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF222Q9UK12 451 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 WIF1Q9Y5W5 379 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRP4O75096 1905 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PFKFB2O60825 505 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RCBTB2O95199 551 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALDOBP05062 364 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLX1NBP0CAT3 122 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CALCBP10092 127 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CELP19835 753 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 NT5EP21589 574 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS8Q16651 343 aa1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms