RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 BTLAQ7Z6A9 289 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SLC7A13Q8TCU3 470 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 STK35Q8TDR2 534 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ABHD3Q8WU67 409 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TMEM239Q8WW34 195 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 STMN2Q93045 179 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DDIT4LQ96D03 193 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 REEP1Q9H902 201 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 VNN3Q9NY84 501 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 U3KQV3 271 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 A0A087WUU8 490 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 H0YHG0 523 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SULT2B1O00204 365 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DVL2O14641 736 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 NPIPB7O75200 414 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 IMPDH2P12268 514 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FCGR1AP12314 374 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 IST1P53990 364 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 UGT2B15P54855 530 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SEC23BQ15437 767 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ATP6AP1Q15904 470 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RRM2BQ7LG56 351 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LUZP2Q86TE4 346 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 STARD4Q96DR4 205 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FUZQ9BT04 418 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 NTN4Q9HB63 628 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MED31Q9Y3C7 131 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RAMP1O60894 148 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 AHSA1O95433 338 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 BAG2O95816 211 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OPRM1P35372 400 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RPS5P46782 204 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LIMS1P48059 325 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RAC3P60763 192 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GUSBP1Q15486 140 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FCRLAQ7L513 359 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PFN4Q8NHR9 129 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RNF128Q8TEB7 428 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TAAR8Q969N4 342 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 EPYCQ99645 322 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PKP2Q99959 881 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 BDH2Q9BUT1 245 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SLC19A3Q9BZV2 496 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 JKAMPQ9P055 326 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TMCC3Q9ULS5 477 aa11.18□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PTPN13Q12923 2485 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PIP5K1CO60331 668 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 E2F6O75461 281 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CH25HO95992 272 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 IL18BPO95998 194 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CGAP01215 116 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FCGR2AP12318 317 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FPR1P21462 350 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms