RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF404Q494X3 552 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MANEALQ5VSG8 457 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 VRK2Q86Y07 508 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF695Q8IW36 515 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LRRC42Q9Y546 428 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 H0YGG7 62 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PRRG2O14669 202 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR2T1O43869 369 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ALOX12BO75342 701 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 F13BP05160 661 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ICAM2P13598 275 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SDHBP21912 280 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CD34P28906 385 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 UBE2KP61086 200 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RAB11AP62491 216 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CEBPEQ15744 281 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 EPGNQ6UW88 154 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SGK3Q96BR1 496 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM19Q96HH6 336 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MYADMQ96S97 322 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MED18Q9BUE0 208 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A0G2JNG1 304 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PP18 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MROH6A6NGR9 719 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 C4orf47A7E2U8 309 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OLFM2O95897 454 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ORM1P02763 201 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 G0S2P27469 103 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PBX1P40424 430 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KIR2DS5Q14953 304 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TP53I3Q53FA7 332 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HTR3DQ70Z44 454 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MMP21Q8N119 569 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PADI1Q9ULC6 663 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DRD2P14416 443 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TGM1P22735 817 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 EFNA3P52797 238 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HBG1P69891 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HBG2P69892 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GPR18Q14330 331 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DPPA4Q7L190 304 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR4K15Q8NH41 348 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 C8orf44Q96CB5 159 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CBLCQ9ULV8 474 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A087WZY1 265 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 WASH4PA8MWX3 477 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 H7C1C5 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 M0QZQ0 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CNIH1O95406 144 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CTSCP53634 463 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LCN6P62502 163 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms