RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZN92 141 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35F2Q8IXU6 374 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIR2DL5AQ8N109 375 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYT14Q8NB59 555 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T34Q8NGX1 318 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF596Q8TC21 504 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTNBP1Q96EV8 351 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGM7Q96PF1 710 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF2Q99496 336 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM246Q9BRR3 403 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPPP3Q9BW30 176 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCRT1Q9BWW7 348 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACTR6Q9GZN1 396 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFB127Q9H1M4 99 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPK1Q9H3S4 243 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRMSQ9H3Y6 488 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBKSQ9H477 322 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIAEQ9HAT2 523 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 PALMDQ9NP74 551 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35D1Q9NTN3 355 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 HPF1Q9NWY4 346 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEC14L3Q9UDX4 400 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 COPS3Q9UNS2 423 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF3AQ9Y496 699 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTCH1Q13635 1447 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBX19O60806 448 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 IDH1O75874 414 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT8P05787 483 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 POU2F1P14859 743 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 HNF1AP20823 631 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 PMELP40967 661 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 QARSP47897 775 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TFPI2P48307 235 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPM6AP51674 278 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACTA1P68133 377 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASPHQ12797 758 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLAQ13239 276 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC10Q5BKY1 277 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM255AQ5JRV8 349 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf220Q5T0J3 134 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC23Q5W5X9 447 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf94Q6P1W5 598 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CES3Q6UWW8 571 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGAP1Q75T13 922 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC80Q76M96 950 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf56Q8IXR9 622 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC65Q8IXS2 484 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM123Q8N131 208 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKFN1Q8N957 763 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4F15Q8NGB8 312 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTX3LQ8TDB6 740 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TM4SF19Q96DZ7 209 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB34Q9BZG1 259 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLMPQ9H6B4 373 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 REEP4Q9H6H4 257 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIPOXQ9P0Z9 390 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPH3ALQ9UNE2 315 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A15Q9Y619 301 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf77C9JDV5 145 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 AIREO43918 545 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUPT3HO75486 399 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED6O75586 246 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP5LO75964 103 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV2-23P01705 113 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 RETP07949 1114 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 IQCF3P0C7M6 154 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPY4P0CV99 314 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPY10P0CW01 314 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPA2P15927 270 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF823P16415 610 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABOP16442 354 aa1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms