RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 V9GY05 133 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 BSGP35613 385 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 STT3AP46977 705 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 HTR5AP47898 357 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 OLIG3Q7RTU3 272 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 OR5J2Q8NH18 312 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 TMEM72A0PK05 275 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 OR8H3Q8N146 312 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ANKRD10Q9NXR5 420 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.9□□□□□ -0.5
USP20-202ENST00000358355 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 C7orf72A4D263 438 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 MEN1O00255 615 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 LGI1O95970 557 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 BIDP55957 195 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 TEX19Q8NA77 164 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 MORN4Q8NDC4 146 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 UCN3Q969E3 161 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 NIPAL2Q9H841 368 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.9□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SHROOM3Q8TF72 1996 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ITGB2P05107 769 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 TPOP07202 933 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 BMP4P12644 408 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 CA5AP35218 305 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ZNF709Q8N972 641 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 IER2Q9BTL4 223 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SLC25A18Q9H1K4 315 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 H3BMQ9 156 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 P2RX1P51575 399 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 FOXK2Q01167 660 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 OR7G2Q8NG99 324 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 COQ8AQ8NI60 647 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ITFG2Q969R8 447 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 COG8Q96MW5 612 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 NMNAT3Q96T66 252 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 OR51B6Q9H340 312 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ASB4Q9Y574 426 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 A0A087WV62 115 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ACTL6BO94805 426 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 CD40LGP29965 261 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 DLSTP36957 453 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ATP1B3P54709 279 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 OR2G6Q5TZ20 316 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 CA13Q8N1Q1 262 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 SLC35A4Q96G79 324 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 UBQLN3Q9H347 655 aa11.89□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 KRBA1A5PL33 1030 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 H7C1C5 153 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 RAC2P15153 192 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 ARSBP15848 533 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 AKR1C2P52895 323 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 LCN6P62502 163 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 LSAMPQ13449 338 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 HBMQ6B0K9 141 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 RAB12Q6IQ22 244 aa11.88□□□□□ -0.51
USP20-202ENST00000358355 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86 ms