RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 MST1P26927 711 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ACVR2AP27037 513 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTT1P30711 240 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR1FP30939 366 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FXYD6P3P58550 94 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 EGR4Q05215 589 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS3BPQ08380 585 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGADQ13349 1161 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6S1Q8NH40 331 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF11Q92914 225 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DDIT4LQ96D03 193 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RNFT2Q96EX2 444 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TSC22D3Q99576 134 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ABI3Q9P2A4 366 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS20P59510 1910 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC3AQ02505 3323 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WZY1 265 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PROB1E7EW31 1015 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IMPA2O14732 288 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF208O43345 1280 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6A2O95222 327 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R3DO95685 299 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB36O95755 333 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 P04436 131 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CD14P08571 375 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 F8A1P23610 371 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP2P41181 271 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGDSP41222 190 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB561P49447 251 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MLLT10P55197 1068 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DLX5P56178 289 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FHL1Q13642 323 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF3Q14653 427 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TIGD6Q17RP2 521 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ALG10Q5BKT4 473 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ACER2Q5QJU3 275 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 BICRALQ6AI39 1079 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NKD1Q969G9 470 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ISOC1Q96CN7 298 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS12Q96DT0 336 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 COG8Q96MW5 612 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMD6Q96NE9 622 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DOK1Q99704 481 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPNQ9BXN1 380 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM72A0PK05 275 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRN3E7EW58 273 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM10O14672 748 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB7O75200 414 aa9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms