RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288840.9

SMAD6-201, Transcript of SMAD family member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD6, Length 3,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6-201ENST00000288840 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 KRT33AO76009 404 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 SIX6O95475 246 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 NRG3P56975 720 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GAB4Q2WGN9 574 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 RTL10Q7L3V2 364 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 OR2L13Q8N349 312 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 OR10A5Q9H207 317 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GBF1Q92538 1859 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PRAMEF2O60811 474 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 AK1P00568 194 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GZMKP49863 264 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 Q6ZS52 159 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.61□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CPED1A4D0V7 1026 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF823P16415 610 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF136P52737 540 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 HSF2Q03933 536 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 FCRL6Q6DN72 434 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 EXO5Q9H790 373 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PDE7BQ9NP56 450 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 NCDNQ9UBB6 729 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 VDAC3Q9Y277 283 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CENPBD1B2RD01 187 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 SCO1O75880 301 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 FOXL2P58012 376 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CA13Q8N1Q1 262 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 NAXEQ8NCW5 288 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TMEM106AQ96A25 262 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CMKLR1Q99788 373 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 MENTQ9BUN1 341 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 DIABLOQ9NR28 239 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CKLFQ9UBR5 152 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CA14Q9ULX7 337 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 V9GY05 133 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 H3BML4 177 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 SLC43A1O75387 559 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 RBBP9O75884 186 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 OR52I2Q8NH67 350 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ARPC5O15511 151 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 KDM4BO94953 1096 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TFP02787 698 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ART1P52961 327 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GFERP55789 205 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 LIPNQ5VXI9 398 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GPAT4Q86UL3 456 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 SERINC4A6NH21 518 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PPM1BO75688 479 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TACR3P29371 465 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 POU4F2Q12837 409 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 FAM53BQ14153 422 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 GIMAP5Q96F15 307 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PELI1Q96FA3 418 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CACNA1EQ15878 2313 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 BRINP1O60477 761 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 SLC16A7O60669 478 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 CD2P06729 351 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ERGP11308 486 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 SRMP19623 302 aa14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SMAD6-201ENST00000288840 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms