RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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SIGMAR1-201ENST00000277010 AQP7P3A6NL99 342 aa20.32■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 FZD7O75084 574 aa20.32■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 P2RY4P51582 365 aa20.32■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.32■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.32■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.32■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 IFI30P13284 250 aa20.31■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SMIM11AP58511 58 aa20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 SEC23BQ15437 767 aa20.31■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPAT4Q86UL3 456 aa20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 SGTBQ96EQ0 304 aa20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 FUZQ9BT04 418 aa20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASPNQ9BXN1 380 aa20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 UCK2Q9BZX2 261 aa20.31■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 CHST11Q9NPF2 352 aa20.31■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM90A27PA6NNH2 459 aa20.3■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 FKBP6O75344 327 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 YES1P07947 543 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 AGAP20933 346 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC17A1Q14916 467 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR2T29Q8NH02 315 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 EMC9Q9Y3B6 208 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 MED12LQ86YW9 2145 aa20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 IL18BPO95998 194 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 CST1P01037 141 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGF2P01344 180 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 PMS2P3Q13401 168 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 BTLAQ7Z6A9 289 aa20.29■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 STARD4Q96DR4 205 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 GP6Q9HCN6 339 aa20.29■□□□□ 0.84
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SIGMAR1-201ENST00000277010 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 ERICH4A6NGS2 130 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 TNFRSF11BO00300 401 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT36O76013 467 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR7A10O76100 309 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 FUT1P19526 365 aa20.29■□□□□ 0.84
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAKP20794 623 aa20.29■□□□□ 0.84
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