RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SHFQ7M4L6 423 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OAFQ86UD1 273 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GLCCI1Q86VQ1 547 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4Q3Q8NH05 313 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM10Q96HG1 83 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CITED4Q96RK1 184 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 BABAM2Q9NXR7 383 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf71A8MTZ7 269 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 C9J4A7 227 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PEPDP12955 493 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 FBLP22087 321 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PITPNBP48739 271 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB37Q5TC79 503 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 VASNQ6EMK4 673 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ACBD7Q8N6N7 88 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SPSB2Q99619 263 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR87Q9BY21 358 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT9Q9HCQ5 603 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CNIH4Q9P003 139 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ENTPD4Q9Y227 616 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ATRXP46100 2492 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD6Q8TD26 2715 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SHISA3A0PJX4 238 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRTM2O43300 516 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR7A2O43488 359 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NCR1O76036 304 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NSA2O95478 260 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 UMODP07911 640 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NPR2P20594 1047 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PYHIN1Q6K0P9 492 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCD3Q6STE5 483 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4M1Q8NGD0 313 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MVB12AQ96EY5 273 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS9Q9BPW9 319 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQ72 361 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CD8B2A6NJW9 211 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ERI3O43414 337 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CD8BP10966 210 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PAICSP22234 425 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AHCYP23526 432 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 STOMP27105 288 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 EVI2BP34910 448 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAG1P54619 331 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RAG2P55895 527 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CD276Q5ZPR3 534 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD8Q6UX82 237 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 KLBQ86Z14 1044 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SCMH1Q96GD3 660 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RBCK1Q9BYM8 510 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A1Q9H2H9 487 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PRORYQ9H606 182 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM36Q9NQ86 728 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNG2Q9Y698 323 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF10Q6WRI0 2623 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00862A6NCI5 91 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CHP2O43745 196 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PLOD3O60568 738 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ICMTO60725 284 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 AGR2O95994 175 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TSFMP43897 325 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R43P59537 309 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IDNKQ5T6J7 187 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A6Q6NXT4 461 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4M2Q8NGB6 313 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2M2Q96R28 347 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf62Q9BQA9 187 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 DPAGT1Q9H3H5 408 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 BTN3A2P78410 334 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP4K2Q12851 820 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51Q1Q8NH59 317 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7D2Q96RA2 312 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCG5Q9H222 651 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CTPS2Q9NRF8 586 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 DUXAA6NLW8 204 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MASP2O00187 686 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ZGLP1P0C6A0 271 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MPIP34949 423 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD13Q7L211 337 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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