RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 OTUB2Q96DC9 234 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ARL5BQ96KC2 179 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 MYADMQ96S97 322 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DPH1Q9BZG8 443 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 GAREM1Q9H706 876 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TREM1Q9NP99 234 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 MED17Q9NVC6 651 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 MBD2Q9UBB5 411 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ASF1AQ9Y294 204 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 NPC1O15118 1278 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 CDK2P24941 298 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 FUT5Q11128 374 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 IL10RAQ13651 578 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 USP53Q70EK8 1073 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 JAM3Q9BX67 310 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 IL21RQ9HBE5 538 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.51□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ACOD1A6NK06 481 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 SYT5O00445 386 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ARL6IP5O75915 188 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ACTL6AO96019 429 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TYRP1P17643 537 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 NT5EP21589 574 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 NAA40Q86UY6 237 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ARL14Q8N4G2 192 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DIO2Q92813 273 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TEAD3Q99594 435 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 OR51M1Q9H341 326 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 KCNAB3O43448 404 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 FADS1O60427 444 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 IGFBP4P22692 258 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 MPIP34949 423 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 SPINT3P49223 89 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 RAB5BP61020 215 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 STX4Q12846 297 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 KRT33BQ14525 404 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ELP5Q8TE02 316 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 FAM117AQ9C073 453 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 OR52D1Q9H346 318 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 NOX4Q9NPH5 578 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 OR14I1A6ND48 311 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 POM121BA6NF01 834 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PPT1P50897 306 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 CAPZA1P52907 286 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 FAM122BQ7Z309 247 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 BEST3Q8N1M1 668 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.5□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 THY1P04216 161 aa14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 S100A8P05109 93 aa14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 S100PP25815 95 aa14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 PSMB10P40306 273 aa14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 TAS2R43P59537 309 aa14.49□□□□□ -0.09
DDX1-201ENST00000233084 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms