RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C5AR2Q9P296 337 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NUDT19A8MXV4 375 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TNFRSF10AO00220 468 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARPC5O15511 151 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HTR2CP28335 458 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF136P52737 540 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GPLD1P80108 840 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BATFQ16520 125 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 OR52N1Q8NH53 320 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HAS2Q92819 552 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GNG13Q9P2W3 67 aa6.71□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LRRC30A6NM36 301 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GPR171O14626 319 aa6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 WNT7BP56706 349 aa6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 ILKQ13418 452 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TNK1Q13470 666 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 EMC4Q5J8M3 183 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 DESI1Q6ICB0 168 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 LACC1Q8IV20 430 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RASD1Q9Y272 281 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HCRTR1O43613 425 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 STK17BO94768 372 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TOXO94900 526 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A6P0DMU7 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A5P0DMU8 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A7P0DMV0 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A8P0DMV1 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A9P0DMV2 189 aa6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 CAMK2BQ13554 666 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RAB6CQ53S08 254 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 AAED1Q7RTV5 226 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SKA3Q8IX90 412 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TEX19Q8NA77 164 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FCRL1Q96LA6 429 aa6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 STARD5Q9NSY2 213 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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CPS1-201ENST00000233072 CLDN6P56747 220 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CLDN17P56750 224 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CLDN2P57739 230 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PLA2G7Q13093 441 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ESX1Q8N693 406 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
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