RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fank1Q9DAM9 344 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PgdQ9DCD0 483 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Twsg1Q9EP52 222 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim2Q9ESN6 744 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Asic5Q9R0Y1 495 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spag17Q5S003 2320 aa9.41□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cfap54Q8C6S9 3106 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nup214Q80U93 2085 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Btbd35f21A0A140T8Q5 498 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ces2gE9PV38 560 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Btbd35f22J3QN64 498 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fcer1aP20489 250 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Copz1P61924 177 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pou3f4P62515 361 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rack1P68040 317 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10750Q3V0I0 133 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd53Q3V0J4 497 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cypt4Q6P925 153 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfsd4aQ6PDC8 510 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 N6amt1Q6SKR2 214 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpatch2Q7TQC7 527 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1065Q7TR70 313 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aoc1Q8JZQ5 751 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc22a22Q8R0S9 554 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r210Q8R274 306 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr651Q8VG78 313 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr61Q8VGM2 311 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cacng6Q8VHW3 260 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcbd2Q9CZL5 136 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plpp6Q9D4F2 292 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gtf2e2Q9D902 292 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9DAR0 182 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Entpd4Q9DBT4 613 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hey1Q9WV93 299 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnrc6aQ3UHK8 1896 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6576F6YTZ4 274 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm20403G3UYB0 123 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r69G3XA45 850 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DgkaO88673 730 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp4a10O88833 509 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgf3P05524 245 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PnmtP40935 295 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfsf9P41274 309 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zdhhc2P59267 366 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 UradQ283N4 178 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NnatQ61979 81 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sidt1Q6AXF6 827 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdh24Q6PFX6 781 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kng2Q6S9I3 644 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eid2Q6X7S9 236 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ldoc1Q7TPY9 151 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1133Q7TR44 313 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plekhm3Q8BM47 761 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FlcnQ8QZS3 579 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc35a3Q8R1T4 326 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cadm4Q8R464 388 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1079Q8VF52 315 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr531Q8VGL2 304 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmed9Q99KF1 235 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cadm3Q99N28 396 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc24a3Q99PD7 645 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spaca7Q9D2S4 182 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dmac2Q9D7K5 258 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ethe1Q9DCM0 254 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aldh9a1Q9JLJ2 494 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajb8Q9QYI7 227 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HraslsQ9QZU4 167 aa9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prob1A0A087WR45 1010 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TomtA1Y9I9 258 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr618K7N6B3 318 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr889L7N1Y6 314 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casp3P70677 277 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Crmp1P97427 572 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Timm8a2Q4FZG7 97 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snap91Q61548 901 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Drd1Q61616 446 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HlxQ61670 476 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slitrk2Q810C0 846 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab43Q8CG50 210 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Faim2Q8K097 317 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mnd1Q8K396 205 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CthQ8VCN5 398 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr686Q8VGX3 317 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhga12Q91XY7 932 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt88Q9CPR6 171 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptp4a3Q9D658 173 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tinf2Q9QXG9 341 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stub1Q9WUD1 304 aa9.39□□□□□ -0.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11214V9GX06 183 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.6 ms