RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chp2Q9D869 196 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif3fQ9DCH4 361 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PaicsQ9DCL9 425 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dctn6Q9WUB4 190 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints1Q6P4S8 2195 aa11.67□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nckap5E9QAE1 1909 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CK137956B1AYM9 596 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10260F6YVP7 152 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amd1P0DMN7 334 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbxa2rP30987 341 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf9P54130 208 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm1123Q1RME4 390 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Commd6Q3V4B5 87 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1133Q7TR44 313 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CyrenQ8BHZ5 157 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad51ap1Q8C551 337 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CipcQ8R0W1 432 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem150bQ8R218 238 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr161Q8VGB9 313 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Edem1Q925U4 652 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lamtor1Q9CQ22 161 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgi1Q9JIA1 557 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TapbpQ9R233 465 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orc5Q9WUV0 435 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr228A0A1L1SR98 313 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc37a4A0A1L1SUI3 450 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp300A2AE21 645 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fndc7A2AED3 737 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esp22A8R0V4 111 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r122D3YU55 309 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adap1E9PY16 374 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r113E9PZA6 856 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8374L7N2A9 172 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mab21l1O70299 359 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01735 133 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ucp2P70406 309 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdv3Q4VAA2 281 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx33Q4VAA7 574 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prm3Q62100 101 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a13Q6A4L0 551 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r40Q7TQB8 319 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag1Q80ZX8 901 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam124bQ8BLQ0 456 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1232Q8VEX7 311 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1378Q8VGH0 315 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr658Q8VGV5 323 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Odf4Q8VI88 290 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd6bQ9D9V7 585 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MeltfQ9R0R1 738 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif26bQ7TNC6 2112 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrdcA0A0G2JEU3 153 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1206A2ATJ9 307 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mthfd2lD3YZG8 338 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2al1oL7MU04 110 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dok2O70469 412 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tead1P30051 426 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabrb1P50571 474 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AmbpQ07456 349 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E2f1Q61501 430 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DmknQ6P253 517 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SnupnQ80W37 358 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Leng9Q8BTN6 485 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc31a1Q8K211 196 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr61Q8VGM2 311 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr569Q8VGZ2 314 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl43Q99N89 183 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrm2Q9CPY0 246 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr45bQ9CR39 344 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snapc3Q9D2C9 407 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elovl4Q9EQC4 312 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gmeb1Q9JL60 562 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mocs2Q9Z223 189 aa11.66□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300cA2A7V7 229 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ajap1A2ALI5 412 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AgmatA2AS89 358 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GlsD3Z7P3 674 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr31F8VQN3 319 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr519K7N645 319 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccrl2O35457 360 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Irs3O54718 495 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4eP63073 217 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gnt4Q1RLK6 350 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf8Q60846 498 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zic2Q62520 530 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PiguQ8K358 434 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr474Q8VFC9 310 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr821Q8VG45 310 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss52Q9D9M0 321 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RfxankQ9Z205 269 aa11.65□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SvaE9PX96 165 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930451I11RikE9Q9R3 111 aa11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.8 ms