RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	LY86	O95711	162 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	UBQLN3	Q9H347	655 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	HTR3B	O95264	441 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TUBG1	P23258	451 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CD80	P33681	288 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NDUFA6	P56556	154 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624		M0QYG6	137 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SYT5	O00445	386 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	IGF2	P01344	180 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SPP1	P10451	314 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SPI1	P17947	270 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GZMM	P51124	257 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CTSC	P53634	463 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NRG3	P56975	720 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	IHH	Q14623	411 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	YY2	O15391	372 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SUSD5	O60279	629 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PTP4A3	O75365	173 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SERPINA5	P05154	406 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GABRA1	P14867	456 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MC3R	P41968	323 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RAB5C	P51148	216 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	BTN3A2	P78410	334 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CBFB	Q13951	182 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	YIPF5	Q969M3	257 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624		H7C1Q1	480 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	FGF18	O76093	207 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C6	P13671	934 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ATF1	P18846	271 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MAOA	P21397	527 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	SIRPA	P78324	504 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	TMEM239	Q8WW34	195 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PXN-222	ENST00000637624	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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