RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N1Y9	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TTL	Q8NG68	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RORB	Q92753	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PR48	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF195	O14628	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FADS1	O60427	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA9	O76027	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LGI1	O95970	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	XG	P55808	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ARF6	P62330	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GLO1	Q04760	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MOG	Q16653	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A096LPK6	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0J9YWU9	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1B0GVI7	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT33A	O76009	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC4	O95801	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GNA14	O95837	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	BCKDHA	P12694	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LSP1	P33241	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ADRA1A	P35348	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	GP5	P40197	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNJ1	P48048	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ACVR1	Q04771	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXF1	Q12946	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	AANAT	Q16613	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MDP1	Q86V88	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440		F8VZ95	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNAP23-223	ENST00000627440	LGALS9	O00182	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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