RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	GPI	P06744	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GUSB	P08236	651 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ARAF	P10398	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	PNMT	P11086	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ACVR1B	P36896	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	PCYT1A	P49585	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	P2RY4	P51582	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CLDN17	P56750	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	EGR4	Q05215	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	DMTN	Q08495	405 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TNK1	Q13470	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	NFYC	Q13952	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	VEZF1	Q14119	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GABRA6	Q16445	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498		M0R082	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GPR171	O14626	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ANGPT2	O15123	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF208	O43345	1280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SSX4	O60224	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TPST2	O60704	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	KRT34	O76011	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TGDS	O95455	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	HPR	P00739	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CD8A	P01732	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	THBS1	P07996	1170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CELA3B	P08861	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	DANCR	P0C864	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	COX5A	P20674	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC6A2	P23975	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CD40	P25942	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	GRPR	P30550	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CAPZA2	P47755	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	SLC16A1	P53985	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	NCALD	P61601	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HCG18-243	ENST00000602498	H3F3A	P84243	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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