RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 LRRC58Q96CX6 371 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 NANOGQ9H9S0 305 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 DSCAMO60469 2012 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 MED13LQ71F56 2210 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 A0A1B0GWA3 101 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 MRASO14807 208 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 FMO6PO60774 539 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 VAMP5O95183 116 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 EGR4Q05215 589 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 KEAP1Q14145 624 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TAB1Q15750 504 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 REP15Q6BDI9 236 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ULK3Q6PHR2 472 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SNX32Q86XE0 403 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 OR10A6Q8NH74 314 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TMEM204Q9BSN7 226 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 A0A0B4J2E0 115 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 A0A1B0GX12 115 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 AKR7A3O95154 331 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 LGI1O95970 557 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CD53P19397 219 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 IGHV1-2P23083 117 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 NTF4P34130 210 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 P2RY4P51582 365 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TSC22D1Q15714 1073 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 VMACQ2NL98 169 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 MMEL1Q495T6 779 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CASP12Q6UXS9 341 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CCDC80Q76M96 950 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TMEM99Q8N816 258 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SLC38A4Q969I6 547 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ARHGDIGQ99819 225 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 NGBQ9NPG2 151 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ASB6Q9NWX5 421 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 LYZL6O75951 148 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 NRF1Q16656 503 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 RABL3Q5HYI8 236 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 OR6S1Q8NH40 331 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SLC47A1Q96FL8 570 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 GID8Q9NWU2 228 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 RASD1Q9Y272 281 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ROS1P08922 2347 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 A0A087WUJ7 227 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 M0QX08 132 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 PDLIM1O00151 329 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 OR2T1O43869 369 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TPST2O60704 377 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CCDC22O60826 627 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 OPN1SWP03999 348 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 GGT1P19440 569 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CD247P20963 164 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 CRYBA2P53672 197 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 VEZF1Q14119 521 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 OR1Q1Q15612 314 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ACKR1Q16570 336 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 DUSP7Q16829 419 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 FAM69AQ5T7M9 428 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ZNF613Q6PF04 617 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 UBE2J2Q8N2K1 259 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 ZIC4Q8N9L1 334 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 SMYD1Q8NB12 490 aa15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HERC3-214ENST00000601319 TAMM41Q96BW9 452 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms