RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WISP2	O76076	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TCRB	P04435	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WNT1	P04628	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	COMT	P21964	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PCSK6	P29122	969 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TNFSF8	P32971	234 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PDX1	P52945	283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CRISP1	P54107	249 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CX3CL1	P78423	397 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CDKL1	Q00532	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	AES	Q08117	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	EMC2	Q15006	297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PSG5	Q15238	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RFX4	Q33E94	735 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		Q75L30	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PTH2	Q96A98	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ITCH	Q96J02	903 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ASB7	Q9H672	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RETN	Q9HD89	108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		H3BNH8	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RHOD	O00212	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	EPHB6	O15197	1021 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TGOLN2	O43493	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZIC3	O60481	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CDC14B	O60729	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CEACAM4	O75871	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FGF19	O95750	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	AP2A1	O95782	977 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TTLL1	O95922	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SERPINA1	P01009	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SP1	P08047	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NGFR	P08138	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CHRNB1	P11230	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ABO	P16442	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MGMT	P16455	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TNFSF9	P41273	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OMP	P47874	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LIMS1	P48059	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MLLT10	P55197	1068 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CDH12	P55289	794 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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