RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586963.1

CAPNS1-203, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-203ENST00000586963 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 AP3D1O14617 1153 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 PDE5AO76074 875 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 LY6HO94772 140 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 VAMP5O95183 116 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SERPINE1P05121 402 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CHRM4P08173 479 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 UQCRBP14927 111 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 IGFBP5P24593 272 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 S100A3P33764 101 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SERPINF1P36955 418 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC1A6P48664 564 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 EPS8Q12929 822 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CEACAM7Q14002 265 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 GGTLC2Q14390 218 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SYPL1Q16563 259 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 TTMPQ5BVD1 217 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM120AOSQ5T036 256 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 AAED1Q7RTV5 226 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 HDXQ7Z353 690 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF440Q8IYI8 595 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 TRIML2Q8N7C3 387 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 TMEM99Q8N816 258 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF781Q8N8C0 355 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 OR9K2Q8NGE7 335 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 FBXO17Q96EF6 278 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CCDC115Q96NT0 180 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 FOXN4Q96NZ1 517 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC35A5Q9BS91 424 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 KATNB1Q9BVA0 655 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 C19orf24Q9BVV8 132 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 PRR14Q9BWN1 585 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 C20orf27Q9GZN8 174 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC35F4A4IF30 521 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CCDC154A6NI56 674 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 E9PBE3 544 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 KLF11O14901 512 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SASH3O75995 380 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 AKR7A3O95154 331 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CRYAAP02489 173 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 IL7RP16871 459 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF23P17027 643 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 LBPP18428 481 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 HNF1AP20823 631 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CXCR1P25024 350 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 P2RY4P51582 365 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC18A1P54219 525 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 BST1Q10588 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 STX3Q13277 289 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SQLEQ14534 574 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 EFNB3Q15768 340 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 TMEM225Q6GV28 225 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 OGFOD2Q6N063 350 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 RNF130Q86XS8 419 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ANKFN1Q8N957 763 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.99□□□□□ -1.29
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