RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	RETREG3	Q86VR2	466 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	STK35	Q8TDR2	534 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	MUS81	Q96NY9	551 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TPST1	O60507	370 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCC2	O75069	709 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD51D	O75771	328 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	FAP	Q12884	760 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	SCARB2	Q14108	478 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP12	Q6UXS9	341 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	NEUROG1	Q92886	237 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	MUCL1	Q96DR8	90 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	PERP	Q96FX8	193 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	PIF1	Q9H611	641 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		19.17	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	EVPLL	A8MZ36	301 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	CLOCK	O15516	846 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD7	O75084	574 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	DANCR	P0C864	163 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR2A	P28223	471 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	PTH2R	P49190	550 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRA6	Q16445	453 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT73	Q86Y46	540 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	C18orf12	Q96KH6	178 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM2	Q9C040	744 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf10	Q9HB07	376 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		19.16	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JND7	137 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A2	P23975	617 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	PTOV1	Q86YD1	416 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		19.15	■□□□□ 0.66
PPP4C-205	ENST00000563200	CIB4	A0PJX0	185 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	VAMP5	O95183	116 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	HIPK4	Q8NE63	616 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXW5	Q969U6	566 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CGREF1	Q99674	301 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR14	Q9BWN1	585 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		19.14	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GWA3	101 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SHISA9	B4DS77	424 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOL3	O00110	214 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPT2	O15123	496 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SOD3	P08294	240 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	DMTN	Q08495	405 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SELPLG	Q14242	412 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM225	Q6GV28	225 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	BIVM	Q86UB2	503 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	GPAT4	Q86UL3	456 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52N5	Q8NH56	324 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	SMR3A	Q99954	134 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	19.13	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	TPST2	O60704	377 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	MFN2	O95140	757 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	AHSA1	O95433	338 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	INHBB	P09529	407 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP1	P29972	269 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	PGGHG	Q32M88	737 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	AAED1	Q7RTV5	226 aa		19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		19.12	■□□□□ 0.65

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