RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	JCAD	Q9P266	1359 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRF3	423 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRM7	423 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PS18	150 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5H15	A6NDH6	313 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SNURFL	B1AK76	121 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX46	H3BTG2	121 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RFXANK	O14593	260 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PSTPIP1	O43586	416 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	AIRE	O43918	545 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL13	O43927	109 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZG16	O60844	167 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FCN3	O75636	299 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	JCHAIN	P01591	159 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP1	P03956	469 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RPN2	P04844	631 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TACSTD2	P09758	323 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF224	P0DH78	156 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LIF	P15018	202 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	COX5A	P20674	150 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MARK3	P27448	753 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SAA4	P35542	130 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMP3	P35625	211 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP12	P39900	470 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NSG1	P42857	185 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC1A1	P43005	524 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYBA2	P53672	197 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH11	P55287	796 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	STX17	P56962	302 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CDR2	Q01850	454 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FADD	Q13158	208 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SELENBP1	Q13228	472 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC1A5	Q15758	541 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF74	Q16587	644 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EIPR1	Q53HC9	387 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SPESP1	Q6UW49	350 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZSR3	168 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNE	Q86WN2	208 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NECAP1	Q8NC96	275 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4F5	Q8NH21	305 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2H4	Q92759	462 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	KIFAP3	Q92845	792 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SMARCD2	Q92925	531 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	STMN2	Q93045	179 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MYDGF	Q969H8	173 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NTNG2	Q96CW9	530 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM122A	Q96E09	287 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM10	Q96HG1	83 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCC1	Q96S66	551 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PSD2	Q9BQI7	771 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GBA3	Q9H227	469 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT4	Q9H2B2	425 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PPA2	Q9H2U2	334 aa		2.35	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	VCX3B	Q9H321	246 aa		2.35	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms