RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 HAS1Q92839 578 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CDS1Q92903 461 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TMEM143Q96AN5 459 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ITCHQ96J02 903 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CEP19Q96LK0 163 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 C4orf45Q96LM5 186 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CPXM1Q96SM3 734 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 RBBP8Q99708 897 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SH3GL3Q99963 347 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 MICU1Q9BPX6 476 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TIMM22Q9Y584 194 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 A0A0G2JNG1 304 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PSMB11A5LHX3 300 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC22A20A6NK97 555 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LMO7DNF2Z398 122 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 M0QXV9 152 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SULT1C2O00338 296 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 DCTN6O00399 190 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC16A4O15374 487 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SGCEO43556 437 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 EFNA2O43921 213 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ADAP1O75689 374 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 UGT2B17O75795 530 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CD160O95971 181 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 IFNA14P01570 189 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 IGHG4P01861 327 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FABP1P07148 127 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SP1P08047 785 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RHOCP08134 193 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 NGFRP08138 427 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FAM106CPP0CH98 169 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CHRNB1P11230 501 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CALCRP30988 508 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 MAP3K8P41279 467 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RANBP1P43487 201 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GLUD2P49448 558 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GNG10P50151 68 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 HLCSP50747 726 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RAP1GDS1P52306 607 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 NUP107P57740 925 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ERVK11-1P61568 191 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 VGLL4Q14135 290 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ZNF234Q14588 700 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 KIR2DS5Q14953 304 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ATP6V1FQ16864 119 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ZNF284Q2VY69 593 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GTDC1Q4AE62 458 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ACTBL2Q562R1 376 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PIGGQ5H8A4 983 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TRNP1Q6NT89 227 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ARMCX5Q6P1M9 558 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RTL4Q6ZR62 310 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CYS1Q717R9 158 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms