RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 SERTM1A2A2V5 107 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 FCER2P06734 321 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CD14P08571 375 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MTHFD2P13995 350 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GRPRP30550 384 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ARL3P36405 182 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SLC6A12P48065 614 aa7.88□□□□□ -1.15
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