RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF347Q96SE7 839 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SEPHS2Q99611 448 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PIP5K1AQ99755 562 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF6Q9Y252 685 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PRQ8 180 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 RAP2AP10114 183 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 OPRM1P35372 400 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SMIM11AP58511 58 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DGCR6Q14129 220 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 GUSBP1Q15486 140 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 P3H2Q8IVL5 708 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PIGXQ8TBF5 258 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 RHCGQ9UBD6 479 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DHRS12A0PJE2 317 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 AQP7P3A6NL99 342 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CIB2O75838 187 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MT-ATP6P00846 226 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 BGLAPP02818 100 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MT-ND1P03886 318 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 UGT2B15P54855 530 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SPATA24Q86W54 205 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ABHD3Q8WU67 409 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 BCO1Q9HAY6 547 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MED31Q9Y3C7 131 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FLNCQ14315 2725 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PNV4 684 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF724A8MTY0 619 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DVL2O14641 736 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DIRAS1O95057 198 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 AKR7A3O95154 331 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 VAMP5O95183 116 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KLK2P20151 261 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FUT4P22083 530 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 P2RY4P51582 365 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC16A1P53985 500 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 LTBQ06643 244 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FOXF2Q12947 444 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF74Q16587 644 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM99Q8N816 258 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SCAIQ8N9R8 606 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PSD2Q9BQI7 771 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FKRPQ9H9S5 495 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A087WUU8 490 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF716A6NP11 495 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TNFSF13O75888 250 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT36O76013 467 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms