RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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CKAP5-212ENST00000533413 H3BN98 237 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 PCDH7O60245 1069 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 IGHV2-70P01814 119 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 HLA-DQB1P01920 261 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 RAF1P04049 648 aa5□□□□□ -1.61
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CKAP5-212ENST00000533413 SUN3Q8TAQ9 357 aa5□□□□□ -1.61
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CKAP5-212ENST00000533413 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5□□□□□ -1.61
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CKAP5-212ENST00000533413 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 A0A1B0GV90 55 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5□□□□□ -1.61
CKAP5-212ENST00000533413 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5□□□□□ -1.61
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CKAP5-212ENST00000533413 ZAR1LA6NP61 321 aa5□□□□□ -1.61
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