RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129		A0A1W2PPZ6	126 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CFAP73	A6NFT4	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC154	A6NI56	674 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	NDUFS8	O00217	210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR4A8	P0C604	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL7R	P16871	459 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CXCR1	P25024	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL12A	P29459	219 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CALCR	P30988	508 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	S100A3	P33764	101 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	P2RY4	P51582	365 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	UFM1	P61960	85 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	HPCA	P84074	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	VRK2	Q86Y07	508 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CMIP	Q8IY22	773 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC115	Q96NT0	180 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZIM3	Q96PE6	472 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SORT1	Q99523	831 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	FKBP7	Q9Y680	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129		E9PBE3	544 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	HAX1	O00165	279 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAAH	O00519	579 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	UPK3A	O75631	287 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	KRT33A	O76009	404 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SERPINE1	P05121	402 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	GPI	P06744	558 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	NR2F1	P10589	423 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRG2	P13727	222 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	LBP	P18428	481 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL2RG	P31785	369 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CR1L	Q2VPA4	569 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	KDM8	Q8N371	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZBTB9	Q96C00	473 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	PANX1	Q96RD7	426 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129		B9A039	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	STAMBP	O95630	424 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CRYAA	P02489	173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CELA3B	P08861	270 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CECR9	P0C854	216 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF23	P17027	643 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC1A6	P48664	564 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	VSNL1	P62760	191 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	NAAA	Q02083	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	HGFAC	Q04756	655 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	GSTA3	Q16772	222 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR52E6	Q96RD3	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GPATCH4-215	ENST00000531129	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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